MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl26

Total Repeats: 109

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011261	TTGA	2	8	58	65	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011261	TGT	2	6	110	115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011261	TTGT	2	8	129	136	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011261	TAT	2	6	145	150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011261	TGT	2	6	158	163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011261	TTC	2	6	164	169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_011261	ATTT	2	8	195	202	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011261	A	6	6	203	208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011261	TATAT	2	10	209	218	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011261	T	6	6	248	253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011261	AT	3	6	266	271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011261	TAAA	2	8	283	290	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011261	TAA	2	6	307	312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011261	TTA	3	9	322	330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011261	TTA	3	9	340	348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011261	ATA	2	6	349	354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011261	AGG	2	6	367	372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011261	A	6	6	1085	1090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011261	AATATA	2	12	2425	2436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011261	AT	3	6	3053	3058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011261	TGA	2	6	3072	3077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011261	AT	3	6	3089	3094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011261	T	6	6	3105	3110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011261	TTTA	2	8	3128	3135	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011261	TTG	2	6	3156	3161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011261	T	7	7	3230	3236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011261	ATGC	2	8	3244	3251	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_011261	GTA	2	6	3295	3300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011261	GTT	2	6	3306	3311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011261	T	6	6	3326	3331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011261	TAT	2	6	3352	3357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011261	T	7	7	3371	3377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011261	CAAAA	2	10	3391	3400	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_011261	TTA	2	6	3410	3415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011261	TATAA	2	10	3419	3428	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011261	GAT	2	6	4821	4826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011261	TAA	2	6	4835	4840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011261	TAA	2	6	4850	4855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011261	ATT	2	6	4900	4905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011261	A	6	6	4906	4911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011261	TA	3	6	5473	5478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011261	TAT	2	6	5922	5927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011261	ATT	2	6	5932	5937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011261	TAT	2	6	5940	5945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011261	T	8	8	5965	5972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011261	TTAT	2	8	5977	5984	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011261	TAAAA	2	10	6042	6051	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011261	A	7	7	6048	6054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011261	ATGT	2	8	6056	6063	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011261	T	6	6	6070	6075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011261	CTC	2	6	6079	6084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_011261	ACAT	2	8	6105	6112	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_011261	T	7	7	6112	6118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011261	A	8	8	6216	6223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011261	CTT	2	6	6245	6250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011261	GTA	2	6	6262	6267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011261	AT	3	6	6268	6273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011261	ATGTT	2	10	6281	6290	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011261	TA	3	6	6300	6305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011261	TA	4	8	7122	7129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011261	TC	3	6	7171	7176	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_011261	GCA	2	6	7241	7246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_011261	TTCT	2	8	7305	7312	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_011261	ATTTT	2	10	7315	7324	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011261	GA	3	6	7346	7351	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011261	T	7	7	7363	7369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011261	T	7	7	7420	7426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011261	CTTTTA	2	12	7444	7455	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_011261	CTTT	2	8	7472	7479	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_011261	ATTT	2	8	7512	7519	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011261	AT	3	6	8006	8011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011261	ATT	2	6	8016	8021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011261	TATT	2	8	8027	8034	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011261	AATT	2	8	8081	8088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011261	TCT	2	6	10537	10542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_011261	A	6	6	10547	10552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011261	T	7	7	10563	10569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011261	T	6	6	10574	10579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011261	TTA	2	6	10590	10595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011261	T	6	6	10596	10601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011261	ATAA	2	8	10609	10616	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011261	ATT	2	6	10627	10632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011261	T	6	6	10631	10636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011261	TA	3	6	10653	10658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011261	AGG	2	6	14013	14018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011261	TCAA	2	8	14588	14595	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_011261	AGG	2	6	18936	18941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011261	TAT	2	6	23512	23517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011261	TTA	2	6	23526	23531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011261	AGG	2	6	24770	24775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011261	TA	3	6	26313	26318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011261	AT	3	6	26330	26335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011261	TTA	2	6	26376	26381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011261	ATTA	2	8	26411	26418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011261	ATT	2	6	26450	26455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011261	CAAAGA	2	12	26519	26530	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_011261	T	7	7	26599	26605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011261	CTA	2	6	26609	26614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_011261	A	7	7	26614	26620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011261	A	6	6	26625	26630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011261	T	8	8	26635	26642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011261	ATA	2	6	26648	26653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011261	TA	3	6	26666	26671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011261	ACA	2	6	26764	26769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_011261	ATGG	2	8	26796	26803	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011261	A	6	6	26828	26833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011261	ACA	2	6	26843	26848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_011261	ATT	2	6	26867	26872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011261	GA	3	6	26875	26880	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.